Masters Cup on koko kauden kestävä yhteispistekilpailu. Kunkin matkan pisteet lasketaan erillisen taulukon mukaisesti. Taulukossa eri ikäluokat on yhdistetty samaan sarjaan kertoimen perusteella. Kertoimet perustuvat edellisen kauden päätteeksi voimassa oleviin ikäsarjakohtaisiin ME-aikoihin 500 m:n ja 1500 m:n matojen yhteispisteiden mukaan keskenään suhteutettuna. Miehet ja naiset kilpailevat samassa sarjassa, mutta kauden päätteeksi palkitaan yhteispisteissä paras mies- ja naisluistelija.
Masters Cup -säännöt kaudelle 2012/2013.